Wetterskip Fryslân onderhoudt en verbetert het watersysteem in de poldergebieden en de vrij afstromende gebieden in haar beheergebied. Deze deelsystemen hebben allemaal hun specifieke eigenschappen, geschiedenis en opgaven voor het waterbeheer. Wel hangt het waterbeheer van de deelsystemen sterk samen met dat van de boezem. De deelgebieden zijn namelijk voor het aan- en afvoer van water grotendeels afhankelijk zijn van de boezem.